联合国大学教授获得世界上最快的生物分子模拟超级计算机的使用权

2017年1月5日,星期四

联合国卫生组织的Harish Vashisth报道
助理教授Harish Vashisth

想象一下, 有那么一瞬间, 你有能力在一天内完成一年的工作.

这正是哈里什·瓦希什所能做的, 多亏了我能接近安东2号, 世界上最快的生物分子模拟超级计算机.

利用的机会 最新版本的超级计算机 两天多的时间是研究人员梦寐以求的, 据瓦实施说, 化学工程助理教授. 他估计,这台机器将产生相当于利用主要研究超级计算机资源两年的结果.

“世界上没有其他机器具有这种生物分子模拟能力,瓦希什说, 他也是 授予对另一个主要计算资源的访问权 -位于圣地亚哥超级计算中心的彗星超级计算机. “使用Anton,我们将能够在短短几天内生成我们将使用和分析几年的数据.”

Vashisth的提议旨在模拟激素胰岛素途径中最大和最重要的蛋白质之一的动力学, 胰岛素受体. 这些蛋白质是糖尿病等主要健康风险的核心因素. 这项研究的数据可能会导致设计新的糖尿病疗法和治疗方法.

“我们的目标是做预测科学,预测蛋白质的功能,”Vashisth说 2016年职业成就奖 美国国家科学基金会的获奖者. “这一切都是永利app新版本官网地址雄心勃勃的模拟.”

瓦西什获准进入超级计算机, 位于匹兹堡大学, 通过由国家研究委员会牵头的竞争性研究提案程序. 首先评估提案的技术可行性,然后根据研究的科学价值进行排名, 证明所要求的资源和调查员的资格和成就. 被选中的提案必须清楚地说明,进入安东2号将如何促进科学突破.

今年晚些时候,Vashisth将从主要研究远程访问计算机. 返回的主要研究人员, 谁占了安东2用户的75%, 首先获得超级计算机的访问权.

为访问计算机做准备, 三年级博士生侯赛因·穆罕默德·迪亚拉尼前往匹兹堡, 宾西法尼亚, 参加11月为期一天的研讨会,以测试Anton 2的模拟. 该研讨会还允许Mohammadiarani成功地将数据转换为与Anton 2的模拟软件兼容.

“教练们知识渊博,穆罕默德迪亚拉尼说, 期望协助研究计划的六名学生之一. “如果我们有任何错误,他们能够解决问题并继续前进.”

摄影师: 
布鲁克斯帕耶特 | 主要研究工程与物理科学学院| 布鲁克斯.payette@dektinary.com | 603-862-5441